尽管人类基因组革命已经发掘出了大量与疾病发生发展密切相关的蛋白靶标，但其中许多蛋白靶标难以为传统小分子药物所利用。因为这些潜在药物靶标没有合适的结合口袋供小分子化合物结合并阻碍其与其他蛋白或核酸相互作用，进而抑制该蛋白功能的发挥。同时，许多蛋白存在于细胞内部，抗体疗法也难以触及这些靶标。因此，我们往往很难发现以转录因子、支架蛋白，和非酶蛋白质等“不可成药”蛋白为作用靶点的药物。此外，传统的小分子药物发挥作用的策略在于占据结合蛋白质上的活性位点，而该作用的持续性是发挥良好药效的关键。因此，为了达到理想治疗效果，通常需要较高剂量的药物以确保较高的体内药物暴露，助长了药物在体内的脱靶效应。

参考文献：

[1] 张振声. 小分子ERRα蛋白水解靶向嵌合体的设计合成及相关生物学活性研究[D]. 暨南大学, 2019.